Путь к добавлению сертификатов ЭЦП: Администрирование->Общие настройки->Сертификаты и приложения.
Путь к доавлению машинночитаемых доверенностей (МЧД): Отчетность->1c Отчетность->Уведомления->Загрузить->МЧД (Выбрать тип МЧД)